中性子線育種は、植物や生物の進化の過程で自然に起きる“突然変異”を、中性子線を利用して“誘発”します。その後、求める突然変異が認められた個体を選抜し、何世代か育て、評価することで新しい品種（系統）を作り出します。
自然界の進化の仕組みを利用しているため、中性子線育種で品種改良された農作物等は安全性が確立されています。
また、人為的に遺伝子を操作するゲノム編集や遺伝子組み換えとは、仕組みが異なるため、審査や規制などが不要です。